​​​​​​​Il Comitato scientifico è l'organo scientifico di maggior rilievo all'interno di Eurac Research​. Il suo ruolo è quello di indirizzare gli studi svolti dalle singole aree e dagli istituti di ricerca e di valutarne i risultati. Il Comitato scientifico svolge, inoltre, un compito di supervisione ed assistenza agli altri organi direttivi, in merito ad ogni questione di carattere tecnico-scientifico.​ Ogni area di ricerca dispone di un subcomitato scientifico composto di specialisti di provenienza europea; l'insieme degli studiosi si riunisce una volta l'anno, a novembre, per valutare i nuovi progetti. È il Consiglio di amministrazione​ ad eleggere ogni tre anni i componenti del Comitato scientifico.